Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SMAGPQ0VAQ4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SMAGPQ0VAQ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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