Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms