Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB2Q08289 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms