Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFF3Q07654 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms