Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4BQ07343 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms