Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAV1Q03135 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAV1Q03135 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms