Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CREMQ03060 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CREMQ03060 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CREMQ03060 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CREMQ03060 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CREMQ03060 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CREMQ03060 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CREMQ03060 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms