Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPEQ02224 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPEQ02224 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPEQ02224 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms