Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL8P80075 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL8P80075 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms