Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF7P61962 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms