Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTBP60709 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBP60709 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms