Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms