Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIK1P57059 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIK1P57059 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIK1P57059 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms