Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC4P56524 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDAC4P56524 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms