Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH15P55291 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH15P55291 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH15P55291 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms