Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GEMP55040 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GEMP55040 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEMP55040 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEMP55040 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEMP55040 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms