Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP2P50120 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBP2P50120 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBP2P50120 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms