Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF6P49848 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF6P49848 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms