Protein–RNA interactions for Protein: P49703

ARL4D, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4DP49703 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL4DP49703 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL4DP49703 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms