Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTAP49354 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTAP49354 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms