Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NESP48681 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NESP48681 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NESP48681 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NESP48681 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NESP48681 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NESP48681 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NESP48681 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NESP48681 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms