Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms