Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms