Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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