Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms