Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLD1P28340 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLD1P28340 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLD1P28340 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms