Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms