Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ABCD3P28288 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ABCD3P28288 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms