Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB4P28070 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms