Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms