Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5A1P25705 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms