Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms