Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms