Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNNI3P19429 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNNI3P19429 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms