Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPCAMP16422 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms