Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms