Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI2P10070 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI2P10070 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GLI2P10070 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI2P10070 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI2P10070 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms