Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms