Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-AP01891 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-AP01891 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-AP01891 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-AP01891 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms