Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCELO95171 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCELO95171 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCELO95171 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCELO95171 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCELO95171 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCELO95171 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms