Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBL3O95164 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBL3O95164 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms