Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms