Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD4O60885 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD4O60885 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms