Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SPAG9O60271 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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