Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRS3O43559 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRS3O43559 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRS3O43559 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FRS3O43559 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRS3O43559 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRS3O43559 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FRS3O43559 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FRS3O43559 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FRS3O43559 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms