Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XRCC2O43543 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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