Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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