Protein–RNA interactions for Protein: O00533

CHL1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1O00533 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHL1O00533 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHL1O00533 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms