Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM1B2RUZ4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms