Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms